搭乗で考えるなら、普通カードで初搭乗1000マイル、区間マイルの10%プラス。
ショッピングマイルは\200=1マイル、SMP(\2100)加入時は\100=1マイル。
年間利用額による優遇などもなく、カードの種別が同じなら、どれを選んでも基本的には違いはありません。

ただ、ポイントサイトという観点でのお勧めという意味合いでは、Suicaポイントを経由することによって
様々なポイントをJALマイルに交換できるということで、JAL-Suicaがいいかもしれません。
ただし、家族カードが発行できない、Suica定期券の機能を付けられない、という点は注意が必要です。

JAL-Suica以外なら、JAL-TOP&ClubQ、JAL-OPクレジットあたりがお勧めになるかと。。。
東急系、小田急系ということで、JALマイルを貯めるのと同時に、各系列のポイントを貯めることができます。

便乗して質問させてください。

私も、tetsutetsuさん同様、ANA-JCBとJMB(クレジット機能なし)を所有しています。
Cypherさんのご提案のように、JALカードSuica(普通カード)への入会を考えています。

ショッピングマイルは、
Suicaへのチャージなどを含めたクレジットカードでの支払い、すべてが対象なのでしょうか?
それとも、Suicaチャージ分は、JR東日本の「ニューサンクスポイント」のみが加算され、ショッピングマイルの加算対象にはならないのでしょうか?

SuicaチャージなどJR東日本での支払いは、ビューサンクスポイントが加算され、ショッピングマイルは加算されません。
http://www.jalcard.co.jp/about/type/suica/about_point.html
http://www.jreast.co.jp/card/jalsuica/point.html

また、JAL-Suica所有者はビューサンクスポイントをJALマイルに交換可能です。(SMP加入で、600p=1000マイル)
SuicaチャージなどへのVIEWプラスの適用もありますので、最大で\1000=6pが付与されることになります。
ですので、VIEW→JALマイルの交換を行う際にSMP加入していれば、Suicaチャージのマイル還元率1%となり、
ショッピングマイルのマイル還元率と同等になります。

Cypherさん、ありがとうございます。

SMP加入のブレイクイーブンは、Suicaのみの利用で考えているので利用額30万円/年かなと…

【加入時】30万円 → 1800VTP → 3000マイル(=4500円)
【未加入】30万円 → 1800VTP → 1500マイル(=2250円)