クーポン特典を利用しても、現金やクレジットカードで購入したのと同様に全てのマイルが付与されます。5000マイルだから、CLUB-Aカード以上の入会搭乗ボーナスですね。

但しクーポン特典で購入すると、航空券を払い戻してもクーポン特典分は払戻しされないので、注意が必要です。

以前、やむを得ない事情(身内の不幸)でキャンセルしたのですが、どんなに事情を説明してもクーポン特典分は返してもらえず、10000マイルを捨てたことがあります。
手数料を引いてでも払い戻してもらえるように改善の要望を出しましたが、いまだに改善されていません。


> Webでのみ購入可能な運賃とは?

そのような注意書きがHPには見当たらないのですが、どこに記述されているのでしょうか?

また、クーポン特典とは「IC利用クーポン特典」と「利用クーポン特典(紙)」のどちらでしょうか。ICと紙のクーポンで、条件が異なります。

http://www.jal.co.jp/jalmile/use/coupon/

でも、特便割引・先得割引等はどちらでも利用できるはずです。ICなら間違いなく利用出来ます。

>そのような注意書きがHPには見当たらないのですが、どこに記述されているのでしょうか?

ここです　↓

https://www.jal.co.jp/jalmile/use/coupon/jalcoupon/info01.html

上から2行目。。。

紙の「JAL利用クーポン特典」の方でしたね。
恐らく「JAL利用クーポン特典」が利用出来ないのは、以下の3つの運賃だと思います。

『JALビジネスきっぷ』
https://www.jal.co.jp/dom/rates/rule/r_business.html
※「JAL利用クーポン」、「JAL IC利用クーポン」ではご購入いただけません。
　⇒ 利用不可と明記されている

『おともdeマイル割引』
https://www.jal.co.jp/dom/rates/rule/r_mile.html
ご予約、ご購入は「インターネット予約・購入サービス」のみで承ります。
　⇒ Webでのみ購入可能な運賃

『eビジネス6』
https://www.jal.co.jp/dom/rates/rule/r_ebusiness6.html
法人向けの出張サポートシステム「JALオンライン」からのみ利用可能
　⇒ Webでのみ購入可能な運賃

その他の特便割引・先得割引等の運賃は利用できるはずです。
でも、非常に分かり辛いですね・・・。改善してもらいたいものです。

何度もありがとうございました。。。