ポイントを他の景品にも変換したいのであれば、応募方式にすればいいと思います。
自動移行の場合は他の景品にできません。
どちらも同じ手数料がかかるのでマイルに変換するのが目的であれば、自動移行の方が毎月の手続きが無いので楽だと思います。

おそらく、JCBのOkiDokiポイントや三井住友カードのワールドプレゼントなどのポイントのことだと思うのですが、応募方式が断然おススメです。

理由の一つは、ポイントとマイルの有効期間。
上記クレジットカードのポイントは有効期間が2年間ですが、応募方式を選んでおけば、2年間ギリギリまでためてからマイルに移行することで、マイルの有効期間3年間と合わせて、最大5年間ポイントをためておくことができます。
しかし、自動移行の場合だと、ポイントを獲得したそばからマイルに移ってしまうので、最大3年間しかためておくことができません。

もう一つの理由は、移行手数料の違い。
上記クレジットカードのポイントをマイルに移す場合、年間2100円の手数料が必要ですが、応募方式を選んで2年に1回マイルに移行するなら、2年間で支払う手数料は2100円のみ。
一方、自動移行を選ぶと、手数料は毎年2100円徴収されるので、2年間で4200円支払うことになります。

> 応募方式と自動移行方式とありますが、どちらを選択したほうが良いのでしょう…? 初歩的なことですみません

ご返答ありがとうございます。 参考になりました!
今回 重い腰を上げ、ANAカードに切り替えることにしたのですが、わからない事ばかりで…
今まで何年もJA○○Sのゴールドで 当たり前のようにギフトカードに交換し、2年前には家族6人のハワイツアー代金を現金で支払い、マイレージの事すら知りませんでした。無知って恐ろしいですね…なんて勿体無い事をしていたのかと後悔するばかりでしたが これから楽しみが増えました!!マイレージ獲得に勤しみたいと思います!