直接の回答には、なってないかもしれませんが・・・
JAL悟空などの正規割引運賃は、ポイントサイト経由で、旅行会社サイトから購入する手段があります。
例えば、Gポイント経由で楽天トラベルでJAL悟空運賃の航空券を購入する、などです。
この方法ですと、Gポイントと楽天スーパーポイントの両方が貯められます。

ただ、この方法だとストップオーバーを含んだり他社利用区間があったりという複雑な旅程だと、JALのサイトからは買えるものでも買えなかったりする場合があります。