> 例えば10%還元商品であれば、BICポイント10%分+WAON利用マイル+WAONチャージマイルの合計となりますか?

その通りです。
BIC CAMERA JMB WAONカードの場合は、上記の BICポイント10%分 を　JALマイル　で貯める事も出来ます。会計毎に、どちらにするかを選べます。
BICポイント:JALマイル=10ポイント:3マイル
なので、私はJALマイルを貯めていますけど、BICポイントにしています。
また、JMB WAONカードをお持ちの場合は、そのカードにBIC CAMERA JMB WAONカードの機能を付加する形になります。モバイルJMB WAONでは確か出来なかったような気がしますが、BICポイントで貯めるのであれば問題ないです。
BIC ⇔ JAL の交換はできないですが。


> また、カード5万円+モバイル5万円の合計10万円までの商品をWAONで払えるものでしょうか?

それは出来ないと思います。断られた経験があります。

お教えいただき、ありがとう御座います。

JALカ-ド(BIC CAMERA JMB WAONカードでは無い)でチャージのWAONで支払いをして、BICポイントはBICポイントカードに貯めるようにします。