AMCカード(Edy機能付き)の発行はOKみたいですよ。
http://www.ana.co.jp/amc/reference/edy/faq/card.html

Q ANAカードを所持していますが、それとは別にANAマイレージクラブEdyカードも持つことは可能ですか?
A はい、ANAカードとは別に、ANAマイレージクラブEdyカードを1枚お持ちいただくことは可能です。お客様のカード発行状況によってお手続き方法が異なりますので下記をご確認ください。

(1) 過去にANAマイレージクラブカードをご利用いただいていた方・・・ANA SKY WEBより、ANAマイレージクラブEdyカードの新規申込は出来ませんので、ANAマイレージクラブカードのお客様番号・パスワードにてこちらよりログインの上、切替え手続きをお願いします。お客様番号・パスワード不明によりログイン出来ない場合は、ANAマイレージクラブ・サービスセンターまでご連絡ください。

> AMCカード(Edyなし)からANAJCBカードに切り替えてマイレージも統合もして
> ANAJCBカード(新しいお客様番号)になっているんですが、Edyの複数枚利用したいので、
> さらにAMCカード(Edy機能付き)の発行ってしてもらえるんでしょうか?

こちらについてはhalさんの書き込みのとおりです。ちなみに
http://tbbs.poitan.net/2418.html#2426
にて私が書いた提携カードも発行してもらえます。
これらの提携カードについては、カード発行後に統合手続きまたはメイン番号変更手続きをする必要があります。

> ちなみに発行してもらったらお客様番号が最新のお客様番号になってしまうんでしょうか?
> 現在使用中のANAJCBカードのお客様番号に統合してもらえるんでしょうか?

以前の私の書き込み
http://tbbs.poitan.net/2140.html#2142
を見てもらうとわかりますが、申し込み時に以前のお客様番号を記入すると、
新しいメイン番号は新しいカードのお客様番号になってしまいますので、
ANA JCBカードのお客様番号をメイン番号に変更してもらうことでひろぴょんさんのご希望通りになります。

halさん はっくさん
丁寧な御回答ありがとうございます!

もっと勉強しなきゃです!!
ありがとうございました。